生物多样性服务和客户

生物多样性服务兴趣小组(BSCI)的目标是从集成软件应用程序(如工作流环境)的角度评估现有生物多样性web服务基础设施的有用性,讨论并商定API设计、稳定性和文档的共同原则,鼓励将有用的Web服务注册到一个基础良好、知名的社区目录,即BiodiversityCatalogue,制作包括背景材料、指南和最佳实践在内的文档。该小组将积极与具有类似目标的项目和倡议合作(如BioVeL、GFBio、LifeWatch、Kurator)。各成员将在外部会议和研讨会上积极宣传研究结果,并鼓励服务开发者采用商定的API原则,并在联合登记系统中记录和宣传服务。

利益集团
图片作者托马斯·克维斯托尔特

召集人

法尔科·格鲁克勒
科学数据管理系主任
自然艺术博物馆
莱布尼茨进化与生物多样性研究所
德国柏林

安东Güntsch
生物多样性信息学研究与开发组组长
柏林弗雷大学
柏林达勒姆植物园和植物博物馆
德国柏林

詹姆斯·麦克林
研究科学家
植物学与生物多样性信息学
加拿大农业和农业食品
加拿大安大略省渥太华

核心成员

姓名 附属
大卫·菲茨穆勒
多米尼克·Röpert
马伦·格莱斯伯格
安德烈亚斯·穆勒
安德烈亚斯·科尔贝克
莫礼时
伯特伦·卢德谢尔
弗洛里安·詹森
艾伦·威廉姆斯
亚历山德拉·内纳迪奇
诺曼·莫里森

动机

生物多样性服务和客户兴趣小组(BSCI)的目标是通过共同服务API设计原则、对客户系统需求的认识、统一的和机器可读的服务文件,促进生物多样性web服务的更好的互操作性,以及一个联合服务注册系统,用于推广和发现服务以及服务监控。在过去的15年里,生物多样性信息学界经历了从数据库驱动、人类可读的门户网站到机器对机器通信的服务基础设施的根本性技术转变。然而,许多新的服务层是孤立设计的,在全球生物多样性面向服务的基础设施中没有被设想为标准化和可靠的功能单元。

利益集团将持续评估生物多样性服务基础设施景观,并协调服务API及其文档的协调流程。一个重要的重点将是分析集成系统(如开普勒和Taverna等工作流环境)中服务可用性的标准、服务api的稳定性和版本控制以及语义互操作性。

参与进来

BSCI集团向所有相关方开放。成员应积极参与小组讨论,并愿意将协调过程的结果应用于他们可能向国际基础设施提供的分析工具和数据集服务。可向利益集团召集人请求成员资格。

历史与背景

召集人在2013年(佛罗伦萨)和2014年(Jönköping)的TDWG年会上主办了生物多样性服务和工作流程研讨会,与会者对此表示了极大的兴趣。两次研讨会的结论都是,迫切需要改进生物多样性信息学服务的标准化和文档化,以避免全球服务API的不协调发展,并推动新一代数据驱动的研究平台和工作流程的发展。与会者一致认为,以TDWG利益集团的形式采取协调一致的做法将有效地推进这一进程。

资源

BSCI服务注册表:http://www.biodiversitycatalogue.org.

BSCI主页、wiki和文档库将通过TDWG网站提供。