普林尼式核心

该小组致力于开发一个数据规范,Plinian Core,可以用来描述生物物种信息的不同方面。“生物种信息”包括与类群有关的各种特性或性状,包括生物学性状和非生物学性状。因此,例如,与描述、法律方面、保护、管理、人口统计学、命名法和相关资源有关的术语被合并。Plinian Core的目的是促进物种和高级分类群的信息交流,包括所有分类群的生物和非生物方面。

任务组
图片By.David Clode.

会议召集人

旧金山潘多省- 真正的jardínbotánico,csic。马德里

核心成员

名称 角色
玛丽亚•莫拉 生物多样性信息学专业知识
威廉尤其 生物多样性信息学专业知识
曼努埃尔·巴尔加斯 生物多样性信息学专业知识
Camila Plata. 生物多样性信息学专业知识
JoséCuadra. 生物多样性信息学专业知识

动机

种级信息是分类专家最需要的服务或产品之一。我们随处可见关于物种的网页:从在线的植物群和动物群,到《濒危野生动植物种国际贸易公约》的海关代理手册,再到自然学家指南。因此,制定数据规范以促进物种页面之间的数据集成和互操作性是一种具有巨大潜力的方法,可以提高效率和协作工作。

什么是scope?

  • 任何种类的生物物体或数据的物种级目录。
  • 与生物收集数据相关的术语。
  • 努力与其他生物多样性相关标准兼容。
  • 便于添加生物数据的组件和属性。

什么不在范围内?

  • 数据交换协议。
  • Non-biodiversity-related数据。
  • 发生水平数据。

Plinian核心设计需要易于使用,独立,能够支持来自多个数据库的数据集成,以及处理不同粒度水平的能力。

目标、产出和结果

  • Plinian Core与其他TDWG标准的关系评估。完成:https://doi.org/10.3897/biss.2.25869
  • 关于普林尼亚核心中包含的不同条款的详细文档。完成:https://github.com/tdwg/PlinianCore/wiki
  • 基于Plinian Core的物种信息系统的至少三种实现。完成(见下文,部分“相关项目和倡议”)
  • 实施和工作的sparql端点和底层本体。完成:https://crossnature.eu/visor/
  • 符合TDWG SDS的标准规范。TG计划于2020年11月27日将文件正式提交给TDWG执行局。正在进行中

成为参与

该集团欢迎各方参与实施物种目录,物种页面或标准的其他用法或其他型材。还有对维持金融核心的稳定性和互操作性的个人有益处。如果您有兴趣参加该组,请联系召集人或核心会员。

历史/上下文

  • Plinian Core始于2004年,是Maria Mora(哥斯达黎加INBio)和Francisco Pando(西班牙gbif)围绕开发一个收集、管理和发布“物种级信息”的共同系统的想法展开的对话。这些想法的基础和用例是INBIO的“物种页面”(UBIS)和“伊比利亚植物光盘”。
  • 在GBIF组织的会议期间开发了更多具体的想法“建筑物种类:我们如何塑造未来?”(阿姆斯特丹,2005)。
  • 2005 - 2006年,维护了Inbio和GBIF.ES之间的强烈协作,从中创建了作为XSD表示的标准的第一个版本,并收到其当前名称:Plinian Core。
  • 2007-2009大学格拉纳达(西班牙)和哥伦比亚生物多样性信息系统(SIB-BOLOMBIA)坚持主动性。
  • INBio开发了PliC的第一个“可实现”版本:被称为“Flat Plinian”。
  • INBio在美洲生物多样性信息网络IABIN (Inter-American Biodiversity Information Network)的背景下,与GBIF合作,在GBIF数据门户Tapir的架构基础上开发了一个“物种和标本”门户。西文
  • 2011年开始与《生命百科全书》合作。将概念模型(后来称为“抽象模型”)与所采用的实现分离的战略决策。CONABIO(墨西哥)成为PliC开发的积极合作伙伴
  • 2012 Plinian核心活动开始与TDWG和程序保持一致;全球化发展。
  • 2012年,Plinian Core开发新阶段的伙伴关系包括格拉纳达大学(UG,西班牙)、哥伦比亚生物多样性信息系统(sibi -Colombia,哥伦比亚)、国家生物多样性知识和利用委员会(Conabio,墨西哥)和圣保罗大学São (USP,巴西),组织工作坊和工作会议,有的由参加者赞助,有的由GBIF赞助。
  • 在2012年开始的开发过程中,新版本Plinian Core v3.1被定义。这提供了更大的灵活性,可以在各种情况下完全表示一个物种的信息。引入了处理知识产权、相关资源、参考文献等方面的新元素,对已经包含的元素进行了更好的定义和记录。
  • “物种信息利益小组”于2013年获得TDWG执行部门的批准。Plinian Core被认为是IG的优先任务。
  • 2014-2018年Plinian岩心首次全面投产(见“相关项目和举措”)
  • 2017 -2019年,与洛杉矶社区协作,推进生活地图集BIE模块的Plinian Core在生活地图集中的实施。(见:Vargas & al., 2018)

资源

相关项目及措施