全球基因组生物多样性网络(GGBN)数据标准

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标题

全球基因组生物多样性网络(GGBN)数据标准规范

创建日期

2016-10-04

状态

标准草案

类别

技术规范

永久IRI

https://doi.org/10.1093/database/baw125

替换

生物采集数据获取的DNA扩展(ABCDDNA)//www.nancyp.com/standards/640

摘要

非模式生物的基因组样本在从发育生物学、生物多样性分析到保护等广泛的研究中越来越重要。基因组样本的定义、描述、质量、凭证信息和元数据都需要数字化并在科学界传播。在当今日益增长的生物信息时代，这些信息需要简洁和一致，以便互补的数据聚合器能够轻松地将数据库相互映射。为了方便的信息交换对基因组样本及其派生的数据,全球基因组生物多样性网络(GGBN)数据标准的目的是提供一个平台基于记录协议,促进有效的共享和使用基因组样本材料和相关样品信息一致的方式。这里提出的新数据标准建立在社区中普遍使用的现有标准的基础上，扩展了它们交换组织、环境和DNA样本以及序列数据的能力。GGBN数据标准将揭示和民主化生物多样性库的隐藏内容，以方便更广泛的生物库社区的每个人。有一些技术工具可以让数据提供者轻松地将他们的数据库映射到标准。

贡献者

Gabi Droege, Katharine Barker, Walter G. Berendsohn, Sean Brady, Carol Butler, E. Margaret Casey, Jonathan Coddington, John Deck, David Fichtmüller, Birgit Gemeinholzer, Anton Güntsch, Jörg Holetschek, Tom Hollowell, Patricia Kelbert, Hans-Peter Klenk, Renzo Kottmann, Christopher Lewis, Chris Lyal, Jacqueline mackzie - dodds, Christopher Meyer，Daniel Mulcahy， Éamonn Ó Tuama, Thomas Orrell, Gitte Petersen, Astrid Schories, Ole Seberg, Jamie Whitacre, Pelin Yilmaz, Holger Zetzsche，张永，周欣，Erica Benson, Boyke Bunk, Enrique Arbeláez Cortés, Boyke Bunk, René Dekker, Markus Döring, Sonya Dyhrman, Paul Flemons, Elisabeth Haring, Thomas Knebelsberger, Ivayolo Kostadinov，Rita T. Lawlor, Jon Norenburg, Sara Y. Nussbeck, Michael Raupach, Thomas von Rintelen, Tim Robertson, Larissa Smirnova, Carola Söhngen, Sun Ying, Lee A. Weigt, John Wieczorek, Kenneth Wurdack, Elizabeth Zimmer

创造者

全球基因组多样性网络(GGBN)

书目引文

Droege等(2016)全球基因组生物多样性网络(GGBN)数据标准规范。数据库。https://doi.org/10.1093/database/baw125

背景

GGBN数据标准是基于ABCDDNA，这是DNA银行网络开发的。目前的GGBN数据标准是对ABCDDNA进行进一步审查的结果全球基因组生物多样性网络社区。该标准的稳定版本1.0可以在http://wiki.ggbn.org/ggbn/GGBN_Data_Standard_v1