GGBN数据标准

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这全球基因组生物多样性网络（GGBN）是一系列来自生命之树，通过生物多样性研究，开发和保护的生命之树划分的基因组组织样本集合的全球网络。该网络将促进分子生物多样性储存库之间的合作，以确保质量标准，提高最佳实践，确保符合国家和国际立法和公约的材料交流。

引文：droege等人。（2016）：全球基因组生物多样性网络（GGBN）标准规范。数据库。DOI：10.1093 /数据库/ BAW125

GGBN数据标准是一组旨在代表与凭证标本，组织样本和收集相关的组织，DNA或RNA样本的组织。参与者:Gabriele Droege, Katharine Barker, Walter G. Berendsohn, Sean Brady, Carol Butler, E. Margaret Casey, Jonathan Coddington, John Deck, Birgit Gemeinholzer, Anton Güntsch, Jörg Holetschek, Tom Hollowell, Patricia Kelbert, Hans-Peter Klenk, Renzo Kottmann, Christopher Lewis, Chris Lyal, Jacqueline mackzie - dodds, Christopher Meyer, Daniel Mulcahy，Éamonn Ó Tuama, Thomas Orrell, Gitte Petersen, Astrid Schories, Ole Seberg, Jamie Whitacre, Pelin Yilmaz, Holger Zetzsche，张永，周新，Erica Benson, Boyke Bunk, Enrique Arbeláez Cortés, Boyke Bunk, René Dekker, Markus Döring, Sonya Dyhrman, Paul Flemons, Elisabeth Haring, Thomas Knebelsberger, Ivayolo Kostadinov, Rita T. Lawlor，Jon Norenburg, Sara Y. Nussbeck, Michael Raupach, Thomas von Rintelen, Tim Robertson, Larissa Smirnova, Carola Söhngen, Sun Ying, Lee A.称重，John Wieczorek, Kenneth Wurdack, Elizabeth Zimmer。

介绍

非模式生物的基因组样本在从发育生物学、生物多样性分析到保护等广泛的研究中越来越重要。基因组样本的定义、描述、质量、凭证信息和元数据都需要数字化并在科学界传播。在当今日益增长的生物信息时代，这些信息需要简洁和一致，以便互补的数据聚合器能够轻松地将数据库相互映射。为了方便的信息交换对基因组样本及其派生的数据,全球基因组生物多样性网络(GGBN)数据标准的目的是提供一个平台基于记录协议,促进有效的共享和使用基因组样本材料和相关样品信息一致的方式。这里提出的新数据标准建立在社区中普遍使用的现有标准的基础上，扩展了它们交换组织、环境和DNA样本以及序列数据的能力。GGBN数据标准将揭示和民主化生物多样性库的隐藏内容，以方便更广泛的生物库社区的每个人。有一些技术工具可以让数据提供者轻松地将他们的数据库映射到标准。GGBN数据标准是基于ABCDDNA，这是在DNA银行网络内开发的。目前的GGBN数据标准是GGBN社区对ABCDDNA进一步审查的结果。GGBN数据标准旨在与ABCD或达尔文核心一起使用，而不是独立解决方案！现在可以提供实现A B C D和Darwincore Archive．对于ABCD，已经进行了两种实现。一个用于单一物种样本ABCDGGBN还有一个是环境样本abcdggbn-enviro.．这里的差异是，GGBN扩展连接到科学名称而不是整个记录。目前不可用达尔文核心档案的GGBN-Enviro实现。

2016年10月:GGBN数据标准v1.0的稳定版本可以在以下网址找到:http://wiki.ggbn.org/ggbn/ggbn_data_standard_v1.


可以找到用于使用GGBN的数据的强制性和推荐字段列表以及有关如何映射数据的信息这里．

请拜访这个页面了解更多关于GGBN数据标准和IPT的信息。

GGBN数据标准条款

贷款，许可，准备和保存术语也可用于标本，而且大多数人到目前为止，ABCD / DWC缺失。引用底层标本或组织分别由相关的（DWC）或UnitSociation（ABCD）完成．

注意：这只是所有GGBN数据标准术语的摘要页面。可以在各个词汇页面上找到使用词汇的建议和示例！

命名空间URI：http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/使用首选名称空间前缀"GGBN.“。




标签: 通过概念名称： 标签: 通过概念名称： 标签: 通过概念名称： 标签: 通过概念名称： 标签: 通过概念名称： 标签: 通过概念名称： 标签: 通过概念名称： 标签: 通过概念名称： 标签: 通过概念名称： 动态术语列表

指向概念的索引(合并的所有集合)

标签: 放大日期•放大方法•放大员工•放大的成功•放大成功细节•相关的参考文献•大胆的流程ID•条形码序列•湮没•阻塞,直到•色谱图文件URI.•克隆菌株•克隆日期•克隆方法•克隆员工•收集许可证•浓度（DNA）•共识序列•共识序列色谱图URI•共识序列长度•合同•版权•DNA熔点•DNA阈值•DNA-DNA杂交•数据使用•处置•结束修复•公平许可•出口许可证•片段长度•凝胶缓冲•凝胶浓度•凝胶持续时间•凝胶阶梯•凝胶言论•凝胶污渍•凝胶污渍浓度•凝胶电压•遗传加入号码•遗传加入Uri.•转基因生物;基因改良生物•Guanin-Cytosine内容•单体型•高的•人类病原体•标识符•进口许可证•知识产权（IPR）•国际认可合规证书(IRCC)•贷款条件•贷款的日期•贷款目的地，贷款•贷款标识符，贷款号•低的•标记•标记数目•标记次额•材料样本类型•材料转让协议(MTA)•媒介•合作备忘录（MOC）•理解备忘录（MOU）•用于测定吸光度浓度和比率的方法（DNA）•重量测定方法•其他•PCR循环编号•PCR复制号码•专利•高于阈值的百分比•允许状态•允许状态限定符•许可证•许可类型•允许URI•许可证•许可证不可用•许可证不需要•植物检疫•质粒•准备日期•准备材料•制备过程•准备类型•编制•保存日期开始•保存温度•保存类型•引物名称•入门名称（前进）•引物名称(反向)•底漆参考引文•底漆参考引文（向前）•底漆参考引文（反向）•引物参考链接•引物参考链接(向前)•引物参考链接(反向)•底漆序列•底漆序列（前进）•底漆序列（反向）•纯化方法(DNA或扩增)•质量•质量检查日期•质量言论•品质的词汇•吸光度比例260/230（DNA）•吸光度比例260/280（DNA）•从......收到•打捞•样品指定•序列(顺序)•排序日期•排序方向•测序方法•排序员工•单序列•单个序列长度•染色法•浓度单位（DNA）•体积单位•重量单位•未知的•兽医证书•体积•重量•适配器•注释源•集会•嵌合检查•估计大小•整理策略•图书馆施工方法•库读取测序•图书馆筛选策略•图书馆大小•图书馆矢量•多路复用标识符•permitstatus词汇•elpittype词汇•相关标准操作程序•样本大小•序列质量检查
通过概念名称： dctrms：标识符•DWC：复杂化•DWC：处置•GGBN：BoldProcessid.•ggbn: DNADNAHybridization•GGBN：DnameltingPoint.•GGBN：DNATHRESHOLD.•GGBN：GC含量•GGBN：扩增•ggbn: amplificationMethod•ggbn: amplificationStaff•GGBN：SAVALIGAUCCESS.•GGBN：SAMPATIZAUCCESSDET.S.•ggbn: barcodeSequence•GGBN：被封锁了•GGBN：Blockeduntil.•ggbn: chromatogramFileURI•ggbn: cloneStrain•ggbn: cloningDate•GGBN：CloningMethod.•ggbn: cloningStaff•ggbn:浓度•GGBN：专注•GGBN：共识序列•GGBN：达成共识SequenceChromatogramFileUri.•GGBN：共识序列•ggbn: endRepair•ggbn: fragmentLength•GGBN：GelBuffer.•ggbn: gelConcentration•GGBN：gelduration.•GGBN：Gelladder.•GGBN：Gelremarks.•ggbn: gelStain•GGBN：GelstainConcentration.•GGBN：Gelvoltage.•GGBN：GeneticAccessionNumber.•GGBN：GeneticAccesseCuri.•GGBN：单倍型•GGBN：Loyanconditions.•ggbn: loanDate•GGBN：Loandestination.•GGBN：贷款派•GGBN：标记•GGBN：MarkerAccordance.•GGBN：Markersubfragment.•GGBN：MatersalAmpletype.•GGBN：MethodDeterMinationConcentrationAndratios.•GGBN：方法确定款项•GGBN：PCRCyclenumber.•ggbn: pcrReplicateNumber•GGBN：Percepabovethreshold.•GGBN：PerpertStatus.•GGBN：PerplatstatusQualifier•GGBN：Permittext.•ggbn: permitType•ggbn: permitURI•GGBN：质粒•GGBN：准备•ggbn: preparationMaterials•GGBN：准备过程•GGBN：制备型•ggbn: preparedBy•GGBN：PreservationDateBegin.•GGBN：保留温度•GGBN：PreservationType.•ggbn：primerrername.•ggbn: primerNameForward•GGBN：PrimernameReverse.•GGBN：PrimerReferencocitation.•GGBN：PrimerReferencecitationForward.•GGBN：PrimerReferenceCitationEreveS.•ggbn: primerReferenceLink•GGBN：PrimerReferencelinkforward.•GGBN：PrimerReferencelinkreverse.•ggbn: primerSequence•GGBN：PrimersequienceForward.•GGBN：PrimerseChenteReverse.•GGBN：PureificationMethod.•GGBN：质量•GGBN：Qualitycheckdate.•GGBN：质量标记•GGBN：比例为260 230•GGBN：比例obsorbance260 280•GGBN：收获•GGBN：SampleDesign•GGBN：序列•GGBN：Semencingdate.•GGBN：SemencingDirection.•ggbn: sequencingMethod•GGBN：SemencingStaff.•ggbn: singleSequence•GGBN：SinglesequenceLength.•GGBN：StainaineMethod.•GGBN：卷•GGBN：乐乐•GGBN：重量•GGBN：WeightUnit.•GGBNVOC：收集许可•GGBNVOC：合同•GGBNVOC：版权所有•ggbnvoc：数据使用•GGBNVOC：豁免许可•ggbnvoc:出口许可证•ggbnvoc:转基因生物•ggbnvoc:人类病原体•GGBNVOC：进口许可证•ggbnvoc:知识产权•GGBNVOC：国际公认的合规证书•ggbnvoc:材料转让协议•GGBNVOC：合作备忘录•GGBNVOC：理解备忘录•GGBNVOC：其他•GGBNVOC：专利•GGBNVOC：许可证•ggbnvoc:允许不可用•GGBNVOC：允许不需要•GGBNVOC：植物检疫•GGBNVOC：抢救•ggbnvoc:未知•GGBNVOC：兽医证书•ggbnvoc：高•ggbnvoc:低•GGBNVOC：媒体•ggbnvoc：permitstatus词汇•ggbnvoc：probity docabulary•GGBNVOC：质量词汇•将:适配器•混合：ANNOT SOURCE•混合：组装•混合：嵌合卫核•预测:将大小•混合：整理策略•混合：lib const meth•混合：lib读取SEQD•将:自由屏幕•混合：lib尺寸•将:自由向量•混合：中间•混合：沉积尺寸•将:seq质量检查•混合：SOP.

GGBN扩增词汇表

指数到 标签: 放大日期•放大方法•放大员工•放大的成功•放大成功细节•大胆的流程ID•条形码序列•共识序列•共识序列色谱图URI•共识序列长度•结束修复•遗传加入号码•遗传加入Uri.•Guanin-Cytosine内容•单体型•标记•标记数目•标记次额•PCR循环编号•PCR复制号码•引物名称•入门名称（前进）•引物名称(反向)•底漆参考引文•底漆参考引文（向前）•底漆参考引文（反向）•引物参考链接•引物参考链接(向前)•引物参考链接(反向)•底漆序列•底漆序列（前进）•底漆序列（反向）•纯化方法(DNA或扩增)•适配器•注释源•集会•嵌合检查•整理策略•多路复用标识符•相关标准操作程序•序列质量检查
通过概念名称： GGBN：BoldProcessid.•GGBN：GC含量•GGBN：扩增•ggbn: amplificationMethod•ggbn: amplificationStaff•GGBN：SAVALIGAUCCESS.•GGBN：SAMPATIZAUCCESSDET.S.•ggbn: barcodeSequence•GGBN：共识序列•GGBN：达成共识SequenceChromatogramFileUri.•GGBN：共识序列•ggbn: endRepair•GGBN：GeneticAccessionNumber.•GGBN：GeneticAccesseCuri.•GGBN：单倍型•GGBN：标记•GGBN：MarkerAccordance.•GGBN：Markersubfragment.•GGBN：PCRCyclenumber.•ggbn: pcrReplicateNumber•ggbn：primerrername.•ggbn: primerNameForward•GGBN：PrimernameReverse.•GGBN：PrimerReferencocitation.•GGBN：PrimerReferencecitationForward.•GGBN：PrimerReferenceCitationEreveS.•ggbn: primerReferenceLink•GGBN：PrimerReferencelinkforward.•GGBN：PrimerReferencelinkreverse.•ggbn: primerSequence•GGBN：PrimersequienceForward.•GGBN：PrimerseChenteReverse.•GGBN：PureificationMethod.•将:适配器•混合：ANNOT SOURCE•混合：组装•混合：嵌合卫核•混合：整理策略•混合：中间•将:seq质量检查•混合：SOP.
概念定义 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/amplificationdate. 标签 放大日期 定义 进行扩增的日期 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 例子 2008-10-17，2007年5月 笔记： 因为大部分确切的日期是未知的 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/amplifiedmethod. 标签 放大方法 定义 用于扩增/PCR的方法。 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/amplifiedstaff. 标签 放大员工 定义 执行扩增的人或机构 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 例子 Jon Doe，NMNH 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/amplilifieduccess. 标签 放大的成功 定义 真/假或是/否是否扩增是成功的;强烈建议举报不成功的运行 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 例子 是的，不，真实，假 笔记： 应该一起使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/amplilifieduccessdetails. 标签 放大成功细节 定义 关于扩增的细节，例如包括它失败了 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 应该一起使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/barcodeSequence. 标签 条形码序列 定义 DNA条形码序列（部分或100％的共有序列） 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/boldprocessid. 标签 大胆的流程ID 定义 DNA序列在粗体数据库中沉积的确定号码或id 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 通常，大胆的记录也在NCBI / EMBL / DDBJ中具有遗传加入号码 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/consensussequence. 标签 共识序列 定义 一致序列源自所有个体序列 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/consensusSequenceChromatogramFileURI 标签 共识序列色谱图URI 定义 链接到一致序列的色谱图 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 例子 应该从http：//开始 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/consensussequencelength. 标签 共识序列长度 定义 共识序列的长度（基对数） 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 例子 697，整数值 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/endRepair 标签 结束修复 定义 说明是否进行了末端修复 被定义为 必需的：不 -可重复：不 笔记： 正在审查HTS图书馆条款 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/gc-content. 标签 Guanin-Cytosine内容 定义 摩尔％的鸟嘌呤 - 胞嘧啶含量 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/geneticAccessionNumber 标签 遗传加入号码 定义 DNA序列在公共数据库中存放的确定数或ID（GenBank / Embl / DDBJ登录号） 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/geneticAccesseuri. 标签 遗传加入Uri. 定义 公共数据库中相关记录的URI（GenBank / DDBJ / EMBL记录） 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 例子 应该从http：//开始 笔记： 这是为了使提供商能够决定要点的位置 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/haplotype. 标签 单体型 定义 单倍型的名称 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 例子 H4，A23 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/marker. 标签 标记 定义 通过PCR扩增的遗传基因座/标记或DNA片段 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 例子 硬币,: 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/markerAccordance 标签 标记数目 定义 两种标本或菌株的两个标记进行比较结果。必须给出比较标本/菌株的名称或税收ID（NCBI）和相对身份百分比 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/markerSubfragment 标签 标记次额 定义 基因或基因座的次帧的名称。重要的是识别标记基因上的特殊区域 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 例子 V6 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/pcrCycleNumber 标签 PCR循环编号 定义 用于PCR的循环数 被定义为 必需的：不 -可重复：不 笔记： 正在审查HTS图书馆条款 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/pcrreplicateNumber. 标签 PCR复制号码 定义 PCR重复的数量，随后汇集并用于排序 被定义为 必需的：不 -可重复：不 笔记： 正在审查HTS图书馆条款 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primername. 标签 引物名称 定义 用于该扩增，克隆或单读的引物的名称 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 可用于ABCD实施;对于达尔文核心档案实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primernameforward. 标签 入门名称（前进） 定义 用于该扩增，克隆或单读的引物的名称 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primernamereverse. 标签 引物名称(反向) 定义 用于该放大，克隆或单读的反向引物的名称 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerreferencecitation. 标签 底漆参考引文 定义 首先参考引物 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 可用于ABCD实施;对于达尔文核心档案实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerreferencecitationforward. 标签 底漆参考引文（向前） 定义 第一次参考的前rimer 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerReferenceCecitationEreverse. 标签 底漆参考引文（反向） 定义 第一引物的第一次参考 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerreferencelink. 标签 引物参考链接 定义 链接到引物的第一个引用 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 可用于ABCD实施;对于达尔文核心档案实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerreferencelinkforward. 标签 引物参考链接(向前) 定义 链接到引物的第一个引用 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerreferencelinkreverse. 标签 引物参考链接(反向) 定义 链接到引物的第一个引用 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primersequence. 标签 底漆序列 定义 引物DNA序列(A,T,G,C;5 ' - 3 ') 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 可用于ABCD实施;对于达尔文核心档案实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerSequenceForward 标签 底漆序列（前进） 定义 正向引物的DNA序列（A，T，G，C; 5'至3'） 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primersequencereverse. 标签 底漆序列（反向） 定义 反向引物的DNA序列（a，t，g，c; 5'至3'） 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/purificationmethod. 标签 纯化方法(DNA或扩增) 定义 用于已经提取的基因组DNA或PCR产物的透明纯化的方法或协议 被定义为 http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/ 必需的：不 -可重复：是的 例子 Qiaamp DNA迷你套件 笔记： 没有受控的词汇;该元素应用于DNA和扩增产品。仅在GGBN扩增词汇中重复 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/apters. 标签 适配器 定义 适配器为样品文库片段的扩增和测序提供引发序列。应该报告两个适配器;在大写字母 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/annot_source. 标签 注释源 定义 对于由社区JAMBAMBOMBOREE或模型生物数据库而不是特定提交者提供注释的情况 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/assembly. 标签 集会 定义 装配如何完成（例如，使用像Phrap或流程图汇编程序等文本的汇编程序）;与完成序列相关的估计误差率（例如，1000 bp中的误差率为1）;和计算方法 被定义为 必需的：不 -可重复：不 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/chimera_check 标签 嵌合检查 定义 嵌合序列，或简称嵌合体，是由两个或两个以上的亲本序列组成的序列。嵌合体通常是PCR产物，当一个过早终止的扩增子重新连接到一个外来DNA链，并在接下来的PCR周期中复制完成时被认为是发生的。嵌合序列从一个父序列改变到下一个父序列的点称为断点或转换点 被定义为 必需的：不 -可重复：不 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/finishing_stretegy 标签 整理策略 定义 是基因组项目，旨在产生完整或草案基因组，覆盖，序列的折叠覆盖率表示为2x，3x，18x等，以及为基因组产生了多少种子 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/mid. 标签 多路复用标识符 定义 分子条形码，称为多路复用标识符（中间），用于在测序运行中专门标记独特的样本。序列应以大写字母报告 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/seq_quality_check. 标签 序列质量检查 定义 指示序列是否已被自动系统（无）调用或经过手动编辑过程（例如，通过检查原始数据或色谱图）。仅适用于未提交给SRA或DRA的序列。没有或手动编辑 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/sop. 标签 相关标准操作程序 定义 用于基因组、元基因组或环境序列组装和/或注释的标准操作程序 被定义为 必需的：不 -可重复：是的

DNA克隆词汇

概念定义 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/clonestain 标签 克隆菌株 定义 个体DNA克隆的名称 被定义为 必需的：不 -可重复：不 概念名称： 规范的URI http://data.gbn.org/schemas/ggbn/terms/cloningdate. 标签 克隆日期 定义 进行DNA克隆的日期 被定义为 必需的：不 -可重复：不 例子 2014-05-18，2013年5月 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/cloningMethod 标签 克隆方法 定义 用于DNA克隆的方法或协议 被定义为 必需的：不 -可重复：不 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/cloningStaff 标签 克隆员工 定义 执行克隆的人或机构 被定义为 必需的：不 -可重复：不 例子 Jane Doe，NMNH 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/plasmid. 标签 质粒 定义 用于测序的质粒的名称 被定义为 必需的：不 -可重复：不 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primername. 标签 引物名称 定义 用于该扩增，克隆或单读的引物的名称 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 可用于ABCD实施;对于达尔文核心档案实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primernameforward. 标签 入门名称（前进） 定义 用于该扩增，克隆或单读的引物的名称 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primernamereverse. 标签 引物名称(反向) 定义 用于该放大，克隆或单读的反向引物的名称 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerreferencecitation. 标签 底漆参考引文 定义 首先参考引物 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 可用于ABCD实施;对于达尔文核心档案实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerreferencecitationforward. 标签 底漆参考引文（向前） 定义 第一次参考的前rimer 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerReferenceCecitationEreverse. 标签 底漆参考引文（反向） 定义 第一引物的第一次参考 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerreferencelink. 标签 引物参考链接 定义 链接到引物的第一个引用 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 可用于ABCD实施;对于达尔文核心档案实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerreferencelinkforward. 标签 引物参考链接(向前) 定义 链接到引物的第一个引用 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerreferencelinkreverse. 标签 引物参考链接(反向) 定义 链接到引物的第一个引用 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primersequence. 标签 底漆序列 定义 引物DNA序列(A,T,G,C;5 ' - 3 ') 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 可用于ABCD实施;对于达尔文核心档案实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primerSequenceForward 标签 底漆序列（前进） 定义 正向引物的DNA序列（A，T，G，C; 5'至3'） 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/primersequencereverse. 标签 底漆序列（反向） 定义 反向引物的DNA序列（a，t，g，c; 5'至3'） 被定义为 必需的：不 -可重复：是的 笔记： 只针对达尔文核心档案实施！对于ABCD实施请使用 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/lib_const_meth 标签 图书馆施工方法 定义 用于克隆库的图书馆施工方法 被定义为 必需的：不 -可重复：不 例子 成对，单身，矢量 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/lib_reads_seqd 标签 库读取测序 定义 从图书馆测序的总克隆数 被定义为 必需的：不 -可重复：不 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/lib_screen. 标签 图书馆筛选策略 定义 在创建克隆库之前和/或在创建克隆文库之前应用的具体富集或筛选方法，以选择特定的序列组 被定义为 必需的：不 -可重复：不 例子 富集，筛选，标准化 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/lib_size. 标签 图书馆大小 定义 为项目准备的图书馆中的克隆总数 被定义为 必需的：不 -可重复：不 概念名称： 规范的URI http://gensc.org/ns/mixs/lib_vector. 标签 图书馆矢量 定义 克隆用于库构建的载体类型 被定义为 必需的：不 -可重复：不

GGBN凝胶图像词汇表

概念定义 概念名称： 规范的URI http://purl.org/dc/terms/identifier 标签 标识符 定义 在给定上下文中对资源的明确引用。 被定义为 http://dublincore.org/documents/dcmi-terms/#terms-identifier 必需的：不 -可重复：不