SYM01机器学习在生物多样性图像分析中的应用
会话类型：研讨会（考虑未经请求的演示）
主办单位：Quentin新郎，Meise Botanic Garden，Meise，比利时;伊丽莎白埃尔伍德，伊迪博伊，佛罗里达大学，洛杉矶，加州大学
公开许可的图像从几历数百万的自然历史收集标本号，作为研究，社区科学和相机陷阱的生物多样性的图像。这只是可能增加，并且增长率也是如此。并行，我们已经看到了具有自动图像分析的许多实验，从而证明了机器学习与生物多样性图像的可行性和有用性。这些技术包括物种鉴定，识别物种相互作用，图像分割，物体检测，特征检测和特征测量。目前，展望对于未来的机器学习研究以及通过机器学习的数据推动的新生态研究的研究，看起来很明亮。然而，我们现在只发现限制是什么以及我们需要支撑此类研究的基础架构。该研讨会将展示机器学习的一些潜在应用以及具有令人鼓舞的研究领域的技术和科学技术。
SYM02 e-floras、e-faunas和物种页面：项目、方法和工具
会话类型：研讨会（考虑未经请求的演示）
主办单位：旧金山潘多省，GBIF西班牙/真正的JardinBotánico-CSIC，西班牙马德里;威廉尤其，密苏里植物园，圣路易斯，密苏里州，美国
地球上每个物种的单独网页（Gewin，2002）的概念出现在许多形式中作为“电子物种页面”：从WikiSpecies和Life（EOL）的百科全书到E-Floras和E-Faunas，以数字现场导游.他们已成为非专家分类学知识的主要信息来源。
数字物种目录显示出用于非常多样化的目标的各种方法。这些项目中的许多项目 - 如果不是数千种物种，并处理生物物种的内在复杂性，它们的划界和相互作用 - 往往是长期和复杂的。新兴的技术和方法可以是这些努力的机会，也是努力维护可取性，可访问性，互操作性和可重用性的原则（公平），例如语义互操作性，独特的标识符，深度学习和大规模协作方法。通过这次研讨会，我们的目标是展示一些最雄心勃勃和创新的编目和传播物种信息的方法，并识别塑造标准和推荐实践的共同点。
该研讨会与此直接相关联TDWG物种信息兴趣集团，并与其他TDWG组，包括分类学概念转移模式（TCS），生物互动数据和生物多样性数据质量。
参考文献：Gewin，V。所有生物，在线。自然418362–363（2002）。https://doi.org/10.1038/418362A
Sym03标本数据提供和动员：贸易商社区电子服务和标准
会话类型：研讨会（没有考虑未经请求的介绍）
主办单位：wouter addink.，天然空科/天然，莱顿，荷兰;谢里夫伊斯兰教，荷兰莱顿DiSSCo/Naturalis
具有自然科学收集的欧洲的机构已开始定义和开发电子服务和标准，作为发展本科委员会研究基础设施的一部分，这将支持全球生物多样性和地理化社区。通过本国人联系项目的资金一直担任催化剂，以开发新的TDWG规范，如CD和Mids。这是基于早期的工作，收集大约600个生命科学和地球科学用户故事，以及对现有标准的差距分析。社区通过CETAF（欧洲分类设施联盟）在富国人（分布式系统）中，通过一系列欧盟委员会资助项目进行了工作。
会议的目标是提供最新的发展现状，并解释正在建设的新TDWG标准，如CD（收藏说明）和MIDS（数字样本的最低信息）将如何支持新的电子服务，如ELViS、欧洲贷款和访问系统，它已经开始运作，要求对欧洲的自然科学收藏进行跨国访问（访问）和虚拟访问（按需数字化）。
本次会议旨在首先对DiSSCo电子服务、演示和开发中的试点项目进行总体概述，然后进行更详细的演示，讨论与DiSSCo相关的一些电子服务和TDWG标准开发，重点讨论这将对全球的收藏和更广泛的社区产生的影响。
SYM04在何处以及如何查找、存储和使用生物多样性数据之间的链接：BiCIKL视角
会话类型：研讨会（考虑未经请求的演示）
主办单位：柳博米尔佩涅夫，Pensoft出版商，索非亚，保加利亚;蒂姆罗伯逊，全球生物多样性信息基金，哥本哈根，丹麦
生物多样性数据是一个连接网，在标本，序列，名称，分类群，图像，物种相互作用，特征，治疗，人员和更多之间。这些连接通常清楚地记录在文献中，甚至以数字形式可用以进行解释。然而，许多，如果不是大多数，则不明确地将这些连接进行连接以在互联网上连接数据。使这些连接明确提高了数据的可辨能，提高了研究效率并实现了新的研究。此研讨会将检查如何在生物多样性数据的元素之间找到链接，如何以及可以存储它们以及如何从它们中提取新信息。它得到了支持BiCIKL项目在未来三年内，将建立生物多样性社区综合知识库，以连接整个生物多样性数据，从而实现新的跨学科研究生物多样性。
该研讨会欢迎显示有关不同方法，保护，注释，管理和重新使用的不同方法，方法和标准的贡献，例如数据仓库，在公平数字对象（FDO）之间连接，链接开放数据（LOD）技术，和别的。
WKSH05翻译TDWG控制词汇
会话类型：研讨会（不考虑主动介绍）
主办单位：Steve Baskauf.，Vanderbilt大学听到图书馆，美国纳什维尔;Paula Zermoglio.阿根廷里约热内卢巴里洛切VertNet
作为一个国际组织，TDWG必须以尽可能多的语言广泛提供其标准。目前，TDWG有六个已批准的受控词汇表，这些词汇表通常只有英文版。作为这些会议的成果，我们将以参加工作会议的翻译人员的语文提供这些词汇中的术语标签和定义。第一个一小时的课程将介绍词汇表的概念，解释术语标签和受控值字符串之间的区别，并描述多语言标签和定义如何适应标准开发过程。在第一次会议之后，将举行一系列一小时的工作会议，这些会议的时间安排是为了方便世界各地的志愿翻译。个人翻译或小组翻译工作在同一种语言将填写谷歌表与他们的翻译。翻译结果将与译者的归属信息一起编译，并以JSON和CSV格式免费提供。
PD06生物多样性研究界管理跨学科数据的挑战
会话类型：小组讨论（不考虑主动发言）
主办单位：金伯利库克，印第安纳大学，布卢明顿，美国;inna kouper.，印第安纳大学布卢明顿，美国
随着研究动机越来越集中于跨多学科的协作工作，需要更多的工作来解决管理跨学科数据的技术和社会挑战。管理生物多样性数据的挑战包括协调形态特征描述和管理数据集的时空分辨率的期望。此外，生物多样性社区需要与研究社会-环境系统的研究小组建立联系。这个小组讨论将提供一个空间，让有各种经验的人来管理跨学科的生物多样性数据，分享他们的知识和专业知识。小组成员将重点讨论不同的数据集在生物多样性社区内的管理、连接和共享方式，以及我们如何利用我们的数据与学术界以外的合作伙伴进行合作。从这次讨论中获得的见解将有助于在一个固有的数据多样化的科学界中找到共同点，并有助于在处理跨学科数据方面的最佳实践和建议。本次会议是一项更广泛的工作的一部分，旨在调查跨所有学科的跨学科数据活动，开发工作流程来支持它，并为跨学科团队提供明智的建议。
SYM07数字扩展样本
会话类型：Keynote +研讨会（没有考虑未经请求的演示）
主办单位：亚历克斯·哈迪斯卡蒂夫大学，加的夫，英国；安德鲁本特利美国堪萨斯大学劳伦斯分校
全体主题演讲将探索数字扩展标本可以通过作为互联网上的对应物体耦合到收集中的物理样本的各种科学;科学，无论是如何完成的，也是非常难以做的。
互补的研讨会会议将探索数字扩展标本（DES）和2021的结果全球社区协商协调人生物多样性知识联盟以及对目前世界自然科学收藏中用于研究的数十亿标本进行数字化展示的令人兴奋的可能性。我们将探讨全球社区如何合作的机制，以及技术细节和解释开放式数据库和其他标准;实施方法;和对机构的影响。
目的是展示人们，流程和工具如何联合起来，并使DES结合在一起，共同努力，为生物多样性和其他自然科学数据建立一个完全集成的下一代数字数据基础架构，其中DES充当连接点的锚点自然科学标本和其他数据的世界，从而可靠的知识和有关所有人可用的自然世界的证据。
来自现场的符号问题，权利对您的科学表：共享生态数据的挑战
会话类型：研讨会（没有考虑未经请求的介绍）
主办单位：Yanina V.Sica.生命地图/耶鲁大学，纽黑文，CT，美国；Paula Zermoglio.，vertnet，bariloche，阿根廷ríonegro
获得高质量的生态数据，例如监测工作产生的数据，对于评估和模拟生物多样性及其时空变化至关重要。面对前所未有的生物多样性丧失，清单数据与实现全球监测和保护目标特别相关。虽然达尔文核心（darwincore）等标准的开发和采用点燃了偶然和机会主义记录的动员和整合，但目前的标准不足以捕捉库存数据的复杂性和层次结构。这加上缺乏足够的激励措施，导致这类数据的调动、整合和再利用有限。目前正在努力制定共享库存数据的标准，即：。，Humboldt Extension.达尔文核心。为了最大限度地发挥这一举措和其他举措的效力，充分获取清单数据中的广泛信息，并促进其更广泛的适用性和使用，不同的缔约方必须进行交流，确定数据共享方面的共同需要和可能性。这次研讨会将汇集来自社区内广泛成员的见解。这将是一个参与讨论的机会，以指导今后为共享生态数据而制定标准的工作。
生物多样性信息学 - 创新和机遇中的Sym09 API
会话类型：研讨会（没有考虑未经请求的介绍）
主办单位：Ben Norton.，北卡罗来纳州自然科学博物馆，罗利，北卡罗来纳州，美国；詹姆斯海滩，指定收藏联盟，劳伦斯，KS，美国
应用编程接口（API）是现代Web的基础。它们使独立的应用程序、系统或数据库能够安全无缝地共享信息，同时保持功能独立性。基于网络的应用程序接口利用这一能力，可以开发社区一级的数字工作流程，将跨平台的生物多样性数据处理集成在一起，从而创建一个全球增值服务生态系统，从本地数据系统中很容易获得。Web API开发方面的创新工作对于解决生物多样性信息学中的许多挑战至关重要。本次研讨会的主要重点是探讨如何以及在何处利用API来促进全球一体化的生物多样性数据基础设施。
主题包括（但不限于）：1.使用API加强和改进现有数据标准。2.创新的方式API可以并将整合和连接全球生物多样性数据社区。3.使用API驱动服务的新数据质量评估和控制技术。4.API为丰富现有数据基础架构、标准和存储库提供的当前功能、限制和机会。5.记录和标准化API的方法和途径。6.API在集合管理系统中的作用，以及这些API如何与全球数据基础设施相适应。
WKSH10实践活动，学习OpenAPI和JSON:API在集合管理系统和其他系统中的使用
会话类型：研讨会（考虑未经请求的演讲）
主办单位：David P. Shorthouse.，加拿大渥太华的农业和农业和农业食品加拿大;法尔科·格鲁克勒，博物馆Fürnaturkunde柏林，柏林，德国
我们的目标是提高对openapi.，和JSON:API规范，用于收集管理和TDWG伞下的其他服务生物多样性服务与客户兴趣集团以及DINA财团(DINA =“自然历史数据的数字信息系统”)。我们将简要介绍这些规范为什么以及如何成为DINA体系结构的核心部分，然后指导参与者完成任务，帮助他们创建、共享和使用OpenAPI和JSON:API。不需要编码技能。对于面向技术的参与者，我们将识别在许多编程语言中使用这些规范的包和公开许可的代码库。我们的目标是通过使用被许多其他社区使用的一致的、经过战斗测试的服务层，改进我们在我们创建的软件中以及我们领导的项目之间的通信层建模的方式。这将迫使我们改进如何沟通我们的需求和概念，如何设计可以互操作的资源，并最终帮助我们实现数据和技术的民主化。
Sym11通过生物多样性遗产库建立协作弹性
会话类型：研讨会（考虑未经请求的演示）
主办单位：康斯坦茨A. RINALDO.，生物多样性遗产图书馆，寺庙，NH，美国;Colleen Funkhouser.，生物多样性遗产图书馆，华盛顿特区，美国
这个生物多样性遗产库（BHL）在2021年庆祝15年，并在整个历史上受到生物多样性社区和其他人的重视。从成立中，BHL的目标是通过外展，通信和参与，以及开发工具和应用程序编程接口（API）来连接数据，以改善对生物多样性数据的访问。BHL的关键实力是社区。由于联盟在成员，内容和复杂性中生长，BHL继续举例说明稳定性和弹性。锁定，隔离和工作的最后一年已经证明了BHL作为丰富的数字库的重要性，以及连接生物多样性数据的工具。BHL已允许工作继续，否则不会在没有物理访问库的情况下进行的。世界各地的BHL合作伙伴继续增强元数据并改善内容交付。正如爱丽丝雷泰尔所指出的那样，Covid危机是“数字进步和转型的加速器”。BHL的自然生态系统实际上合作，支持开放的科学，并建立一个强大的社区。BHL的协作弹性为更大的生物多样性社区及以后提供了价值。 This symposium will focus on the trajectory of BHL’s strategic plan and review new tools and advances.
SYM12通过知识图形连接生物多样性数据
会话类型：研讨会（考虑未经请求的演示）
主办单位：罗德里克·D·M·佩奇，格拉斯哥大学，格拉斯哥，英国;弗兰克·米歇尔，科特迪亚兹大学，CNRS，Inria，Sophia Antipolis，法国
将生物多样性数据联系在一起是生物多样性信息学中许多举措的隐含目标。分类管理数据库是资源描述框架（RDF）的早期采用者，是语义Web的构建块。从2006年开始，他们在RDF中达到数百万个分类名称，每个分类名称都有一个全球独特的标识符，如生命科学标识符（LSID），因此似乎是“生物多样性知识图”，我们的互联数据网络似乎成熟了我们可以用来发现分类群，他们的名称，相关出版物，标本，出现，特征，表型，DNA序列以及工作能够创造知识的人之间的联系。
然而，生物多样性知识图没有自发地组装自身，这表明在知识图形成为集成和探索生物多样性数据的关键工具之前需要完成更多的工作。本次会议将探讨构建和开发生物多样性知识图表的进度和前景，无论是围绕更广泛的努力，如Wikidata或DBPedia，或者更多地专注于ozymandias和Openbiodiv等具体领域的举措。除了这些案例研究之外，会议中的发言人将探讨TDWG标准之间的关系，诸如JSON-LD等数据格式，如BioSchemas等标记词汇，以及角色纳米轿厢可以发挥传播和连接生物多样性知识。会议还将欢迎关于基辅生物多样性知识图和更“传统”生物多样性数据来源的联合开发和交叉施肥的演示。
SYM13如雨后春笋般涌现，社区科学和分享生物多样性数据
会话类型：研讨会（考虑未经请求的演示）
主办单位：罗伯史蒂文森，麻州大学波士顿，波士顿，美国马萨诸塞州；比尔·希罕，真菌多样性调查（基金），雅典，乔治，美国
真菌在生态系统中扮演着重要的角色，通过再循环物质和与植物形成重要的伙伴关系。然而，估计表明不到5%的真菌物种在分类文献中被描述。这个研讨会汇集了来自四大洲的业余和专业科学家，来描述他们和他们的组织是如何记录真菌多样性的。蘑菇是业余爱好者研究真菌多样性的一个自然切入点，因为蘑菇长期以来一直被人类采集作为食物和药用。会谈描述了信息技术，包括应用程序、数据库、平台、标准（包括TDWG标准）以及影响项目开发和演进的受控词汇表。特别注意用于连接现场观察与标本收集和DNA序列的联系，以帮助克服真菌分类学上的不确定性。演讲者描述了与业余爱好者合作的策略、业余爱好者对参与的态度、数据质量问题以及从他们的项目中获得的科学产品。
SYM14社区建设，为我们共享数据的未来
会话类型：研讨会+面板（考虑未经请求的演示）
主办单位：小冬青，美国华盛顿史密森学会国家自然历史博物馆；丽贝卡·斯奈德，美国华盛顿史密森学会国家自然历史博物馆
随着我们继续扩大我们全球信息学景观的全球信息，地质和人类学域名，我们越来越加强了在与此领域中的数据一起使用数据时无法单独的想法。协作，协调和交叉功能努力对于创建公平（可找到的，可访问，可互操作和可重复使用）和关怀（集体利益，控制，责任和道德）数据的数据，以及实施支持研究基础设施的成功至关重要数据标准和标识符。本次会议邀请发言人分享现有或拟议的模型，用于制定社区，帮助确保促进驾驶这项工作的人民越来越多的全球数据资源的人们的成功和可持续协调。我们正在广泛地考虑社区，在当地或全球层面，重点关注整个组织和方案的信息。我们如何作为社区改善最佳实践，专业知识和能力的共享？我们可以从建设和加强惯例社区时学习的挑战，成功和障碍是什么？
符号15维护分类骨干（或连接尝试的人）
会话类型：研讨会+演示(未经请求的演示)
主办单位：维杰巴夫，普渡大学，印第安纳州，美国;尼古拉斯J。邋遢的，密尔沃基公共博物馆，密尔沃基，威尔，美国;特蕾莎修女j . Mayfield-Meyer，密尔沃基公共博物馆，阿尔伯克基，新墨西哥州，美国
分类学定义了我们每个生物的共同概念，作为生物科学的基础骨干。策划分类名称列表传统上在线发布的印刷品和最近发表，但在线发布，它们通常在发布后迅速逐步过时，只有那些发布它们的人很少维护。在创建分类名称资源的同时，遇到各种挑战以及一些伟大的解决方案。在本届会议中，我们建议将TDWG的成员汇集在一起分享贸易的伎俩，相互学习，并在分类名称游戏中连接重要资源。我们预计会议成为研讨会和示范的组合。我们邀请策划分类名称名单的人员或团体的摘要列出了在制定和维护策划分类名称列表中产生的挑战，解决方案和工作流程。
Sym16吃或被吃掉：不要错过交互数据
会话类型：研讨会（考虑未经请求的演示）
主办单位：何塞·奥古斯托·萨利姆巴西圣约Paulo大学圣约Paulo分校；马尔滕特雷克斯比利时佛兰德斯梅斯植物园
科学家使用各种方法来收集，记录和储存生物学相互作用数据（例如捕食者 - 猎物，寄生虫，粉碎机 - 工厂）和该数据的用途同样多样化。同时，众多努力正在有效地汇总，组织和传播生物互动数据。但是，我们没有正式标准来支持生物交互数据共享和互操作性。本次研讨会的目的是为参与的人提供机会，或者对数字化生物互动数据进行数字化以分享他们的经验和想法，以便我们可以前进并提出用于共享生物交互数据的共同（标准化）模型。这个生物相互作用数据兴趣小组（BID-IG）是TDWG内的正式组，在生物多样性信息学社区中正在讨论该主题。在研讨会期间，我们将提供关于本集团成就的更新，欢迎其他有关方面呈现其工作，特别是与用于共享和集成生物交互数据的不同格式，模型和存储库相关的其他人。
符号17确保信任社区科学生物多样性平台：政策和方法
会话类型：研讨会（没有考虑未经请求的介绍）
主办单位：伊丽莎白埃尔伍德，idigbio，洛杉矶，加利福尼亚州，美国;罗伯史蒂文森麻州大学，波士顿，波士顿，麻省，美国
公民科学家收集的数据弥补了生物多样性发生数据的强大和成长部分，但仍然讨论了生产，识别和提供高质量，值得信赖的数据的最佳方法。公民科学经理，项目和平台如何简化工作流程，使得产生的数据是值得信赖并准备进行研究的？对评估公民科学数据的可信度最有助于哪些指标？是否有可能达到值得信赖的数据是明显的，并为自己说话？在这个研讨会上，由此举办TDWG公民科学感兴趣集团扬声器将讨论值得信赖的数据，项目和平台可以以编程方式分类，识别和识别数据质量的方式，以及标准和协议在强大的公民科学项目中的作用。
符号18发现已知的生物多样性：数字可访问知识
会话类型：研讨会（没有考虑未经请求的介绍）
主办单位：多纳特·阿戈斯蒂，普拉齐，伯尔尼，瑞士；Alexandros Ioannidis-pantopikos，Zenodo - Cern，Meyrin，瑞士
科学出版是建立我们的知识，通过连接事实使用一个复杂的网络隐式和显式引用。分类学出版物异常丰富，从出版物的显式引用开始，到分类学名称、处理引文、材料、参与者、集合提供的隐式引用，再到特定领域的词汇表。从某种意义上说，我们仍然生活在一个模拟的世界里，因为我们的大部分知识甚至不是数字的，或者大部分知识充其量是供人类消费的，而不是数字可访问的知识（DAK）。DAK是人类和机器可读的事实，它们是开放的、可查找的、可访问的、可互操作的和可重用的，由诸如全球生物多样性信息设施（GBIF）等外部服务的重用来证明。DAK的第二个方面是它的引文用各自的标识符进行注释。这允许与现有DAK轻松集成和/或连接。
发现已知的生物多样性是普拉齐面临的一项挑战。这就需要对数据、可持续的基础设施、工作流程、参考词汇、资源和策略进行明确的目标解析，以发现和转换一个令人望而生畏的、约5亿页的、快速增长的出版物。将重点介绍目前的技术和持续发展。
UNCF19 API不一致
会话类型：设置的
主办单位：黛博拉·保罗，伊利诺伊州自然历史调查，物种档案组，美国伊利诺伊州香槟市；Quentin新郎，Meise Botanic Garden，Meise，比利时;尼古尔森，Kew，Richmond，伦敦，英格兰;Matthew Yoder，伊利诺伊州自然历史调查，物种档案组，香槟，伊利安，美国;David Shorthouse，Ag-Canada，渥太华，加拿大;猫查普曼，Idigbio，佛罗里达大学，普雷斯维尔，佛罗里达州
这个半天的研讨会/黑客马拉松将探索我们的全球社区是如何通过我们的集体应用程序编程接口(api)如何在理论上或实际上连接在一起。我们关注现有的数据服务api有几个好处。首先，它关注于实际构建的软件，而不是概念验证试点项目;这暴露并阐明了标准和实现之间的差异，以便双方都能进行改进。其次，它探索了一个长期的未来场景，在这个场景中，每个数据提供者都公开他们自己的API和科学家，用户爬过“源”，而不是源的推断或解释版本。也就是说，如果我们目前不能链接现有的api生态系统，我们可以在哪里进行改进以满足这个愿景?
首先，我们将一起快速枚举我们每个人都知道的现有api。我们的目标不是全面的，而是聚合已知的应用程序资源(这本身就是一个很好的可访问性代理测试)。从那里，我们将继续我们的能力，在提供的时间内，通过链接api，并记录这些链接，以三种方式:1)通过快速观察来自2个或更多api的响应的一些组合可以用来做X，即。“理论上联系”;2)通过识别跨两个或多个提供商的特定(真实)API调用集，这些提供商代表一个特定的用例。3)在时间允许的情况下，通过编写小的概念证明来演示跨两个或更多api的集成，例如:“实际联系”。这三种方式都可以根据参与者的兴趣并行运行。我们计划在每个类别中提供一个小奖品。
最后修改日期：2021年5月31日